El Consejo Asesor del CEA es el órgano encargado de establecer y aprobar las directrices generales del Centro, cuyas funciones son:

• Proponer al Consejo Universitario de la UNED, las políticas institucionales específicas o referidas a la temática de educación ambiental.
• Aprobar y apoyar los planes estratégicos, operativos y presupuestarios propuestos por el Consejo Académico para el Centro.
• Avalar el informe anual de labores de la Dirección del Centro antes de su envío a las instancias respectivas de la UNED.
• Avalar y tramitar los convenios o cartas de entendimiento que el Centro se proponga firmar cuando comprometan recursos o impliquen responsabilidades para el Centro y la Universidad.  
• Asesorar a la persona que se encuentre ocupando la Dirección del Centro en todos los aspectos requeridos para su buena marcha.
• Aprobar el Manual de Procedimientos del Centro.